A hagyományos benzines és dízel erőforrások mellett a Fiat a 90-es évek vége óta kiemelt figyelmet szentel a károsanyag kibocsátás csökkentésének, melyet 2007-ben az EU is elismert. Ez az irány jól illeszkedik a Multipla innovatív, úttörő filozófiájához, így az elsőként kapta meg az új tervezésű, alternatív üzemanyagokkal működő motorváltozatokat is.

A Multipla motorjai:

• 1.6i (benzin) - 1998-2007, 1.6/16V, Euro 2-3
• 1.9 JTD (dízel) - 1998-2007, 1.9/8V, Euro 2-5
• BiPower (benzin/metán) - 1998-2004, 1.6/16V, Euro 3
• BluPower (metán) - 1998-2004, 1.6/16V, Euro 5, (CO2 167g/kg)
• GPower (benzin/LPG [Liqiud Petroleum Gas]) - 1.6/16V, Euro 4
• Natural Power (benzin/metán) - 2004-, 1.6/16V, Euro 4

Még 1998-ban elkészült a Multipla benzin-elektromos meghajtású, vagyis hibrid változata is. Bevezetését 1999-re tervezték és bár néhány tesztpéldány létezett és fotók is készültek róla, mégsem került gyártásba. Ennek okait nem ismerjük, de talán feltételezhető, hogy a Fiat akkoriban kezdődő pénzügyi válsága idején nem maradtak források a modell sorozatgyártásának beindításához. További ok lehet, hogy az alapmodell fogadtatása a megosztó forma miatt üzletileg rossz volt, így feltehetően az új és drága technológia alkalmazása nem térült volna meg.

A Multipla alapvetően kiváló autó, ám különböző évjáratai között akadnak kisebb különbségek. Az felépítés és szerkezet persze mindegyiknél ugyanolyan, de például a korai (1999-2000) modelleknél gyakori a belső műanyagok gyenge minősége, a könnyű karcosodás, törés és egyéb apróbb konstrukciós kiforratlanságok, melyek a gyártás során fokozatosan visszaszorultak.

Az 1999-es jelzésű, legelső darabokat talán arról lehet a legkönnyebben megismerni, hogy az anyósülés előtti kesztűtartó még fedél nélküli volt. Ezeket egyébként már 1998 végétől kezdve árulták Európa szerte. A korai Multiplákon, ahogy a Fiat egyéb korabeli modelljein is, a motorra és felszeretségre utaló szám-betű kombinációk még megtalálhatóak voltak oldalt, az első sárhányókon is. Egyes, fejlődő országok piacaira készült modelleket már gyárilag alváz- és üregvédelemmel láttak el, illetve a felszereltség részét képezte a kartervédő.

A 2000-es modellben fedelet kapott a jobb oldali rekesz.

A 2001-es változatot már 2000 őszétől forgalmazták, ekkor került sor az első modellfrissítésre is. Ennek legszembeötlőbb külső jele az innentől kerek, koszorús, kék Fiat embléma a szélvédő alatt. Szintén külső azonosító jegy, hogy eltűntek az oldalsó típusjelzések. A dízel 5 lóerővel (JTD 110) erősebb motort kapott, a műszerek között fordulatszám és vízhőfok mérő, illetve új kompjúter jelent meg. Rendelhető lett a színre fújt lökhárító és a kalaptartó.

Ezt követően a 2002-es modellen egy jelentősebb frissítés következett. Amellett, hogy jelentősen javult a kivitelezés minősége, tovább erősödött a JTD motor, immár 115 LE-s lett. Valamennyi változaton komfortosabbá vált a futómű hangolása, az ELX-en alapfelszerelés lett a színre fújt lökhárító és rendszámtábla-keret. Néhány ponton megerősítették a karosszériát a 2001-es töréstesztek tanulságai alapján, továbbá a légzsákok felfújódását immár a legújabb nemzedékhez tartozó szenzorok felügyelték, az utas testsúlyának megfelelően. A modellt nem bocsátották ismét az NCAP tesztjeire, de feltehetően lényegesen jobban szerepelt volna immár az egykori 3 csillagnál. 2001-ben egyébként elsősorban a frontális ütközésnél jelentkeztek gondok, az oldalvédelme akkor is jó volt már.
Változtak az utastérben felhasznált anyagok is, az SX verzió új szöveteket, az ELX bársonyszerű kárpitozást kapott, illetve kívánságra a szövetborítású műszerfal puha műanyagosra lett cserélhető. Rendelhető lett a deréktámasz a vezetőülésbe és megújult a hátsó fejtámlák formája is. Leengedve már rácsúsztak a támlára, jóval kevesebbet takarva ki így a látótérből parkolásnál. A hátsó elektromos ablakokat becsípődés elleni védelemmel látták el és a gyerekülések biztonságosabb elhelyezésre szolgáló ISOFIX pontokat építettek az autóba. 13 színből lehetett választani, amiből 5 volt új (Indy Green, Pareo Yellow, Artemis Green, Antarctic Blue and Canary Blue), az addigi kazettás Hi-Fi fejet pedig CD-re cserélték és immár 6 lemezes CD-váltót is lehetett rendelni.

És még egy érdekesség ebből az évből: a Fiat a 2002-es modellciklus elején, tehát 2001 októberétől kezdve az első sorozatokat hátul is tárcsafékekkel szerelte, így is harangozta be az azévi változatot. Azonban váratlanul, még 2001 novemberében visszaállt a hátsó dobfékre (az utolsó szériában 4 tárcsával szerelt a ZFA18600002151655 alvázszámú darab volt). Ezek után hátsó tárcsaféket csak extra opcióként lehetett rendelni és kizárólag a Fiat menetstabilizáló rendszerével (DVC) együtt.
E furcsaság okairól semmit nem tudunk hivatalosan, de tény, hogy a hátsó tárcsafékes verzióknak volt visszahívása is, mert a fékcsövet kidörzsölhette a kézifék kábele és megoldásként talán egyszerűbb/olcsóbb volt visszatérni a jól bevált megoldáshoz a rendszer áttervezése helyett. Mondjuk ezt magam sem hiszem igazán... Mindenesetre a fékhatás szempontjából - hátsó fék esetén - nincs valódi jelentősége a kérdésnek egy átlagos autónál, ugyanakkor az is tény, hogy a tárcsafék sokkal jobban mutat a könnyűfém kerék mögött... és ez sem elvetendő szempont :)

A már a kezdetektől piacon lévő Bi- és BluPower után ekkor jelent meg a Gpower változat (benzin-LPG) is, melynek hatalmas előnye az utólag beépíthető LPG-szettekkel szemben, hogy a gázt még folyékony állapotban fecskendezi a motorba, amivel jelentősen megnő a hatékonysága, teljesítménye pedig alig marad el a benzinesétől. Eközben a fogyasztása is jelentősen javul. A Gpower választható volt egy illetve két gáztartállyal is, tartályonként 320km-es hatótávot biztosítva. A Fiat megoldása alaphelyzetben is sokkal magasabb biztonságot nyújt az utólag beépíthetőeknél de a gyártó ezen felül is ellátta ezt a verziót egy tűzvédelmi rendszerrel, vagyis FPS-sel (Fire Protection System).

Az extrafelszerelések listája is gazdagodott, hiszen olyan kiegészítőkkel lett bővíthető immár a típus mint a kombinált telefonantenna, vagy a CONNECT névre keresztelt telematikai rendszer. Az addig rendelhető, nagy képernyős gyári navigációt viszont a rádió helyére beépíthető DIN méretűre cserélték. Opcióként rendelhetővé váltak az oldalütközéskor az oldallégzsákok hatását fokozó függönylégzsákok is, a dízelekhez pedig Webasto állófűtést is lehetett rendelni.